Interpretacja podobieństwa DNA

[Ochocka_Magda]

Sytuacja wygląda tak: wspólne podobieństwa DNA u matki i dziecka, przy czym u matki bardzo małe, w granicach 8-10 cM, jeden wspólny segment z matchem, natomiast u dziecka większe, dwa lub trzy segmenty wspólne z matchem, całościowo ok. 20-22 cM. Jaka jest najbardziej prawdopodobna interpretacja? Czy taka, że match jest spokrewniony z dzieckiem zarówno ze strony matki, jak i ojca? Czy też to krewny ze strony ojca, a u matki to tylko fałszywe podobieństwo? Najprościej byłoby to zweryfikować wprawdzie wynikami ojca, ale nie chce się przetestować. Zauważyłam już kilka takich przypadków, chyba 5 czy 6.
Pozdrawiam,
Magdalena.

[julia_jarmola]

Pani Magdo, w kwestii interpretacji DNA, radziłabym napisać także post na Genealogii Genetycznej.

Pozdrawiam,
Julia.

[Żaryn_Marta]

Sytuacja wygląda tak: wspólne podobieństwa DNA u matki i dziecka, przy czym u matki bardzo małe, w granicach 8-10 cM, jeden wspólny segment z matchem, natomiast u dziecka większe, dwa lub trzy segmenty wspólne z matchem, całościowo ok. 20-22 cM. Jaka jest najbardziej prawdopodobna interpretacja? Czy taka, że match jest spokrewniony z dzieckiem zarówno ze strony matki, jak i ojca? Czy też to krewny ze strony ojca, a u matki to tylko fałszywe podobieństwo? Najprościej byłoby to zweryfikować wprawdzie wynikami ojca, ale nie chce się przetestować. Zauważyłam już kilka takich przypadków, chyba 5 czy 6.
Pozdrawiam,
Magdalena.

W tej sytuacji mamy dwie możliwości:
1) Tak jak wspomniałaś - dalekie pokrewieństwo dziecka z krewnym zarówno ze strony matki jak i ojca
2) Segmenty fałszywie dodatnie. Na ilu segmentach dziecko ma match 20-22cM? Bo rozumiem, że matka 8-10cM ma na jednym segmencie? Im więcej drobnych segmentów, tym większe szanse na wynik fałszywie dodatni.

Czy dziecko i matka były przetestowane w tej samej firmie?

Pozdrawiam ciepło,
Marta Sobota

[swigut]

Sytuacja wygląda tak: wspólne podobieństwa DNA u matki i dziecka, przy czym u matki bardzo małe, w granicach 8-10 cM, jeden wspólny segment z matchem, natomiast u dziecka większe, dwa lub trzy segmenty wspólne z matchem, całościowo ok. 20-22 cM. Jaka jest najbardziej prawdopodobna interpretacja? Czy taka, że match jest spokrewniony z dzieckiem zarówno ze strony matki, jak i ojca? Czy też to krewny ze strony ojca, a u matki to tylko fałszywe podobieństwo? Najprościej byłoby to zweryfikować wprawdzie wynikami ojca, ale nie chce się przetestować. Zauważyłam już kilka takich przypadków, chyba 5 czy 6.
Pozdrawiam,
Magdalena.

W zależności od technologii - i biochemicznej i informatycznej - fragmenty 8-10cM mogą być fałszywymi pozytywnymi. Jeśli to myheritage to w zasadzie na pewno jest to fałszywy wynik. Jeśli 23andme albo ancestry to jest szansa, że to jest wynik rzeczywisty.

Jeśli matka ma mniejsze podobieństwo do probanda niż dziecko to sugeruje, że albo matka i ojciec są spokrewnieni np. są kuzynami 3-5 stopnia lub pochodzą z endogamicznej populacji, albo, że proband jest podwójnym kuzynem dziecka - też z reguły sugeruje endogamię do pewnego stopnia. Takie przypadki się zdarzają często z probandami z USA, gdzie imigranci przez 2-3 pokolenia żenili się w kręgach towarzyskich tej samej miejscowości z której wyemigrowali - np. kuzyn dziadka probanda był kuzynem babki dziecka a kuzyn babki probanda był kuzynem dziadka matki dziecka.

Tomek